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草原毛蟲(Lepidoptera:Lymantriinae:Gynaephora)是一個(gè)小型昆蟲類群,全世界記錄有15個(gè)物種,,分布在北極凍土帶和北半球的高海拔地區(qū),。在中國,所有8個(gè)被命名的Gynaephora物種都棲息在海拔2900-5000米的青藏高原地區(qū),。草原毛蟲是青藏高原高寒草甸最具破壞性的害蟲,它們不僅取食牧草,,導(dǎo)致嚴(yán)重的飼草短缺和草地退化,,還會(huì)引起家畜和野生動(dòng)物的口腔黏膜潰瘍。
草原毛蟲不同發(fā)育階段形態(tài)圖
草原毛蟲很好地適應(yīng)了青藏高原的嚴(yán)酷環(huán)境,。在形態(tài)上,,幼蟲覆蓋著密集的黑毛,這有助于它們抵抗高強(qiáng)度的紫外線輻射并調(diào)節(jié)體溫,;在生理上,,雌性成蟲與雄性成蟲相比,不發(fā)育翅膀和觸角,,表現(xiàn)出顯著的性別二態(tài)型,,能量優(yōu)化分配到繁殖而非變態(tài)中,有助于提高適合度,;在遺傳上,,與非青藏高原昆蟲相比,草原毛蟲中與缺氧反應(yīng),、能量代謝和DNA修復(fù)相關(guān)的幾個(gè)基因受到正選擇,。線粒體基因的序列變異和表達(dá)模式變化也與適應(yīng)不同的高海拔環(huán)境有關(guān),。
草原毛蟲的比較基因組學(xué)分析
我校青藏高原昆蟲生態(tài)與害蟲防治團(tuán)隊(duì)就青海草原毛蟲(Gynaephora qinghaiensis)的基因組進(jìn)行了組裝。組裝后的基因組大小為861.04 Mb,,由107個(gè)contig組成,,contig N50大小為18.65 Mb。BUSCO分析顯示,,組裝體中含有99.56%(99.27%完整,,0.29%片段化)的BUSCO基因。在青海草原毛蟲基因組中,,預(yù)測(cè)有580.2 Mb(占基因組的67.4%)的重復(fù)序列和16 618個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,。系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)分析表明,青海草原毛蟲與銹色卷蛾(Orgyia antiqua)大約在1830萬年前分化,。此外,,基因家族進(jìn)化分析表明,青海草原毛蟲基因組中,,有130個(gè)基因家族顯著擴(kuò)張,,43個(gè)基因家族收縮。參考基因組的可用性,,可為揭示草原毛蟲對(duì)高海拔環(huán)境的適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制提供遺傳資源,,也有助于制定草原毛蟲的綜合防控策略。
相關(guān)研究結(jié)果以“Genome assembly of the grassland caterpillar Gynaephora qinghaiensis”為題在Nature旗下期刊Scientific Data上發(fā)表,。該研究得到了青海省科技廳重點(diǎn)研發(fā)與轉(zhuǎn)化計(jì)劃專項(xiàng)(2023NK152)和青海省昆侖英才專項(xiàng)的支持,。
供稿:農(nóng)林科學(xué)院
【編輯:鄒林有 責(zé)任編輯:金萍】